虽然步进电机应用的非常广泛，能够在应用中取得非常阿訇的表现，对很多设备的运行使用都起到了极大的而优化促进作用，这是不可否认的事实。但同时也不能否认的是，此种电机也是存在着一定缺点的。

步进电机存在的缺点，主要是受自身制造工艺的闲置促成的，比如步距角的大小由转子齿数和运行拍数决定,这样在转子齿数和运行拍数有限的情况下，电机的步距角通常就比较大并且是固定的。这样的步距角状态，会导致电机存在步进的分辨率低、缺乏灵活性及在低频运行时振动产生的噪音较高这类缺陷问题，同时也更容易使物理装置产生疲劳或被损坏。这些都是步进电机存在的缺点，并且这些缺点也会在电机的应用中有具体的体现，会影响到其优化应用效果的呈现。

不过虽然步进电机存在着一定的缺点，但是对着科技水平的提高和行业的而进步，其很多缺点都已经被解决好，即便是一些不能彻底解决的缺点，也已经得到了较大程度的改善，所以当前的步进电机是能够充分满足很多使用需求，在应用中的多个方面都取得极佳表现的。